Os primeiros periódicos científicos foram criados em 1665 e com o desenvolvimento da tecnologia de informação e comunicação e a invenção da internet, houve uma migração para o ambiente digital. Surgem aí, segundo Reis e Giannase-Kaimen (2007 apud Martignago, 2018, p. 50), os periódicos eletrônicos. Na era da cultura digital, são evidenciados vários impactos nas publicações que incluem oportunidades e desafios. Metodologicamente, este artigo é fruto de uma pesquisa de natureza qualitativa, exploratória e bibliográfica, de uma revisão de literatura narrativa, bem como de uma reflexão crítica sobre a reconfiguração da comunicação científica, especificamente dos periódicos científicos, a partir do impacto dos processos e ferramentas da cultura digital. Buscou-se evidenciar de que maneira a cultura digital está influenciando o fluxo editorial dos periódicos científicos, as ações de todos os atores envolvidos no processo, a visibilidade das publicações, a mensuração do impacto, o  enfrentamento dos vieses imbricados nas lógicas das redes, os desafios éticos e  as oportunidades trazidas pela era digital.